DNA-synteesin tehokkuuden määräävät tekijät

Tyypillisessä DNA:n, RNA:n ja ei-luonnollisten nukleiinihappojen synteesissä suojauksenpoisto- ja kytkentävaiheella on ratkaiseva rooli.

Suojauksenpoistovaihe on poistaa DMT-ryhmä kiinteästä kantajasta tai 5'-hydroksyyliryhmä edellisestä nukleosidista orgaanisella hapolla ja paljastaa hydroksyyliryhmä seuraavaa kytkentävaihetta varten.3 % trikloorietikkahappoa dikloorimetaanissa tai tolueenissa käytetään enimmäkseen suojauksenpoistovaiheen suorittamiseen.Trikloorietikkahapon pitoisuus ja suojauksenpoistoaika (suojauksenpoistoaika) hallitsevat lopputuotteiden puhtautta.Alhainen konsentraatio ja riittämätön deblokkausaika jättävät DMT-ryhmän reagoimatta, mikä vähentää saantoa ja lisää ei-toivottuja epäpuhtauksia.Pitkä suojauksen poistoaika voi johtaa syntetisoitujen sekvenssien depuriiniin muodostaen odottamattomia epäpuhtauksia.

Kytkentävaihe on herkkä liuottimien vesipitoisuudelle ja ilman kosteudelle.Veden pitoisuuden synteesissä tulee olla alle 40 ppm, mieluummin alle 25 ppm.Vedettömän synteesin kunnon säilyttämiseksi nukleiinihappojen synteesi tulee suorittaa alhaisessa kosteudessa, joten suosittelemme asiakkaallemmeAmidiitit liuenneet laitteet, joka voi liuottaa jauhemaisen tai öljyisen fosforamidiitin vedettömään asetonitriiliin välttääkseen kosketuksen ilman kanssa.

DNA-synteesin tehokkuuden määräävät tekijät5
DNA-synteesin tehokkuuden määräävät tekijät4

Koska fosforamidiitit liukenevat paremmin vedettömissä olosuhteissa, ja molekyyliloukut adsorboivat reagensseissa ja amidiitissa olevan hivenveden, on valmisteltavaMolekyylianssit.Suosittelemme 2 g seulaa 50-250 ml reagenssipulloille, 5 g 250-500 ml reagenssipulloille, 10 g 500-1000 ml reagenssipulloille ja 20 g 1000-2000 ml reagenssipulloille.

Fosforamidiittien liuotus tulee suorittaa inertissä ilmakehässä ja aktivaattorireagenssien ja asetonitriilin vaihto tulee suorittaa ajoissa.Korkki- ja hapetusreagenssit tulee käyttää mahdollisimman pian, avatut reagenssit antavat vähemmän säilyvyyttä ja vähemmän aktiivisuutta synteesin aikana.


Postitusaika: 09.08.2022